某医学博士在派对上被一名透明人杀死，透明探员特纳（彼得?人国费辛利 Peter Facinelli 饰）与丽萨在勘察现场时却被告知此案由国防部接手，而他二人的透明泛目录技术教程任务是保护女生物学家道尔顿（劳拉?里根 Laura Regan 饰）。另一方面，人国透明人在杀死医学博士前，透明得知令自己身体好转的人国缓冲药剂只有道尔顿才能提供……　　特纳与丽萨在保护道尔顿的当夜遭透明人袭击，利萨殉职，透明特纳在突然出现的人国军方包围中才明白道尔顿和自己都不过只是军方用来诱捕透明人的饵。愤怒的透明泛目录技术教程特纳带着道尔顿从军方的控制下逃跑，并要求后者说出透明人与军方千丝万缕联系之背后的人国真相。同时军方将特纳锁定为追捕对象，透明一场围绕军方、人国透明人和特纳三方的透明阴谋与追踪开始上演。