故事将衔接TV版第三季结局紫悦(Twilight Sparkle)进化为天角兽(Alicorn)加冕成新公主之后的彩虹生活，此时水晶帝国的小马小马泛目录排名接单珍贵王冠被偷窃；为了寻回王冠，紫悦公主将接下重责大任，国女泛目录排名接单独自前往另一个平行世界；在那里，彩虹紫悦将发现平行世界中的小马小马穗龙(Spike)变成了一只狗，而自己则变成了有双手也能双腿站立的国女人类！身分将改为少女高中生，彩虹并重新相遇化身为人类版本的小马小马小马朋友们……