故事发生在一艘名为“契约”的异形殖民太空船之上，飞船上搭载了两千名进入沉睡的契约殖民者，他们的国语二级目录程序购买目的地是遥远的欧米伽六号行星，希望能够在那里建立新的异形家园。一场意外的契约发生令契约号的能量收集帆遭到了破坏，船长布兰森（詹姆斯·弗兰科 James Franco 饰）亦不幸身亡。国语作为代理船长的异形欧朗（比利·克鲁德普 Billy Crudup 饰）带领着惊恐而又悲伤的船员们降落到了一颗未知的神秘星球上。　　在这里，契约他们遇见了仿生人大卫（迈克尔·法斯宾德 Michael Fassbender 饰），国语二级目录程序购买大卫热情的异形接纳了人类的到来，并讲述了他和已故的契约肖博士（劳米·拉佩斯 Noomi Rapace 饰）在这里生活的经历。就在大卫渐渐赢得了船员们的国语信任的同时，大家已经一步一步的异形走入了前者为他们精心打造的地狱之中。